Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp11Q9CZJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp11Q9CZJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp11Q9CZJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp11Q9CZJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms