Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rex1bdQ9CYZ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rex1bdQ9CYZ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rex1bdQ9CYZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rex1bdQ9CYZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms