Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp8Q9CY28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp8Q9CY28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp8Q9CY28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtpbp8Q9CY28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp8Q9CY28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms