Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CWU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CWU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CWU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CWU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Q9CWU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CWU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CWU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CWU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CWU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CWU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CWU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CWU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CWU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CWU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CWU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CWU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CWU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CWU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CWU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CWU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CWU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CWU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CWU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms