Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdca4Q9CWM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdca4Q9CWM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdca4Q9CWM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca4Q9CWM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdca4Q9CWM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdca4Q9CWM2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdca4Q9CWM2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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