Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sppl3Q9CUS9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sppl3Q9CUS9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sppl3Q9CUS9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sppl3Q9CUS9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sppl3Q9CUS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms