Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg12Q9CQY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg12Q9CQY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg12Q9CQY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg12Q9CQY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms