Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl20Q9CQL4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl20Q9CQL4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl20Q9CQL4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl20Q9CQL4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms