Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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