Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem223Q9CQE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem223Q9CQE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem223Q9CQE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem223Q9CQE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms