Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CQC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CQC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CQC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CQC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9CQC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9CQC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CQC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CQC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9CQC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9CQC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9CQC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CQC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CQC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9CQC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CQC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms