Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Med4Q9CQA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Med4Q9CQA5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Med4Q9CQA5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Med4Q9CQA5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Med4Q9CQA5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Med4Q9CQA5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms