Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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Trpd52l3Q9CQ14 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Trpd52l3Q9CQ14 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Trpd52l3Q9CQ14 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Trpd52l3Q9CQ14 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Trpd52l3Q9CQ14 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Trpd52l3Q9CQ14 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms