Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt23Q99PS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt23Q99PS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt23Q99PS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Krt23Q99PS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt23Q99PS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt23Q99PS0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms