Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim11Q99PQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim11Q99PQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim11Q99PQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim11Q99PQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim11Q99PQ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim11Q99PQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim11Q99PQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms