Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12aQ99PQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12aQ99PQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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