Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ0

Ntm, Neurotrimin, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NtmQ99PJ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NtmQ99PJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NtmQ99PJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NtmQ99PJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NtmQ99PJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NtmQ99PJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NtmQ99PJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms