Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RetnQ99P87 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RetnQ99P87 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RetnQ99P87 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RetnQ99P87 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms