Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trem2Q99NH8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trem2Q99NH8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trem2Q99NH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trem2Q99NH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trem2Q99NH8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trem2Q99NH8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms