Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rad54l2Q99NG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Rad54l2Q99NG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rad54l2Q99NG0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Rad54l2Q99NG0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Rad54l2Q99NG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rad54l2Q99NG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rad54l2Q99NG0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Rad54l2Q99NG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms