Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp1b4Q99ME6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atp1b4Q99ME6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp1b4Q99ME6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp1b4Q99ME6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp1b4Q99ME6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Atp1b4Q99ME6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Atp1b4Q99ME6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms