Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm2d1Q99MB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm2d1Q99MB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm2d1Q99MB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms