Protein–RNA interactions for Protein: Q99M51

Nck1, Cytoplasmic protein NCK1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck1Q99M51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nck1Q99M51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nck1Q99M51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck1Q99M51 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck1Q99M51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms