Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms