Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gps1Q99LD4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gps1Q99LD4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gps1Q99LD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gps1Q99LD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gps1Q99LD4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms