Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EtfaQ99LC5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EtfaQ99LC5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EtfaQ99LC5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EtfaQ99LC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms