Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf34Q99KR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf34Q99KR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf34Q99KR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf34Q99KR6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf34Q99KR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms