Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apobec3Q99J72 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apobec3Q99J72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apobec3Q99J72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apobec3Q99J72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apobec3Q99J72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apobec3Q99J72 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms