Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ophn1Q99J31 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ophn1Q99J31 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ophn1Q99J31 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ophn1Q99J31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ophn1Q99J31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms