Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcoln1Q99J21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mcoln1Q99J21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mcoln1Q99J21 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcoln1Q99J21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcoln1Q99J21 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcoln1Q99J21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms