Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1Q922D8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mthfd1Q922D8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mthfd1Q922D8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mthfd1Q922D8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mthfd1Q922D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mthfd1Q922D8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms