Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcaf2Q921K8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcaf2Q921K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcaf2Q921K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcaf2Q921K8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf2Q921K8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcaf2Q921K8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms