Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg13Q91YI1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg13Q91YI1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg13Q91YI1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg13Q91YI1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg13Q91YI1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg13Q91YI1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg13Q91YI1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms