Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tm4sf4Q91XD3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm4sf4Q91XD3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm4sf4Q91XD3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf4Q91XD3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms