Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usb1Q91W78 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usb1Q91W78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usb1Q91W78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usb1Q91W78 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms