Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r200Q8R281 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r200Q8R281 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r200Q8R281 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r200Q8R281 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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