Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b4Q8QZY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b4Q8QZY9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b4Q8QZY9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms