Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkl1Q8K4J6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkl1Q8K4J6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkl1Q8K4J6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkl1Q8K4J6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkl1Q8K4J6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkl1Q8K4J6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms