Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms