Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp45Q8K387 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp45Q8K387 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp45Q8K387 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp45Q8K387 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.1 ms