Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms