Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim68Q8K243 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim68Q8K243 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim68Q8K243 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim68Q8K243 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim68Q8K243 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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