Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rasgef1bQ8JZL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1bQ8JZL7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rasgef1bQ8JZL7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rasgef1bQ8JZL7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms