Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CIL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CIL4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CIL4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CIL4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CIL4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CIL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CIL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CIL4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CIL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CIL4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CIL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CIL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms