Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG3

Gcc2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc2Q8CHG3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gcc2Q8CHG3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gcc2Q8CHG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gcc2Q8CHG3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gcc2Q8CHG3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gcc2Q8CHG3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gcc2Q8CHG3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gcc2Q8CHG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Gcc2Q8CHG3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gcc2Q8CHG3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms