Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr47Q8CGF6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdr47Q8CGF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr47Q8CGF6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr47Q8CGF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms