Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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