Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxw17Q8CFE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxw17Q8CFE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxw17Q8CFE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw17Q8CFE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxw17Q8CFE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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