Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc28aQ8CEI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc28aQ8CEI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc28aQ8CEI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28aQ8CEI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28aQ8CEI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms