Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228aQ8CDW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam228aQ8CDW1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam228aQ8CDW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms