Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8CD60 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8CD60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8CD60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CD60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CD60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CD60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CD60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CD60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CD60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CD60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CD60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CD60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CD60 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CD60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CD60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q8CD60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CD60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CD60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CD60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CD60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8CD60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8CD60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8CD60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8CD60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CD60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CD60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CD60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CD60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CD60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CD60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CD60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CD60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CD60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CD60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CD60 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CD60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CD60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CD60 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CD60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CD60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CD60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CD60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CD60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8CD60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8CD60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CD60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CD60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8CD60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CD60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CD60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8CD60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8CD60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8CD60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8CD60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8CD60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8CD60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8CD60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CD60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q8CD60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q8CD60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CD60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CD60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CD60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CD60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CD60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CD60 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CD60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CD60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CD60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CD60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CD60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8CD60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8CD60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8CD60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8CD60 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q8CD60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8CD60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8CD60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8CD60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8CD60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8CD60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8CD60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8CD60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8CD60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms